RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM87BQ96K49 555 aa21.76■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA2Q9UL42 364 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB5O15062 677 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CPA1P15085 419 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK1Q96PY6 1258 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF24Q9UPV7 400 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQY0 241 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CTAGE5O15320 804 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 RTP1P59025 263 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 MTA3Q9BTC8 594 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA4P34932 840 aa21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 RNF180Q86T96 592 aa21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 SNX17Q15036 470 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM60Q495X7 471 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TLK2Q86UE8 772 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNB2Q92953 911 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 VTA1Q9NP79 307 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-218ENST00000511185 KCNA10Q16322 511 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-218ENST00000511185 RGS22Q8NE09 1264 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.68■■□□□ 1.06
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SH3BP2-218ENST00000511185 RMDN3Q96TC7 470 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PXMP2Q9NR77 195 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX3-2P78367 333 aa21.66■■□□□ 1.06
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SH3BP2-218ENST00000511185 GNASQ5JWF2 1037 aa21.66■■□□□ 1.06
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