RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 TBC1D5Q92609 795 aa34.07■■■■□ 3.05
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LIMCH1-211ENST00000509638 USP6NLQ92738 828 aa34.06■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 PSTPIP2Q9H939 334 aa34.06■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 SH3GLB2Q9NR46 395 aa34.06■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa34.06■■■■□ 3.04
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LIMCH1-211ENST00000509638 HSD17B4P51659 736 aa34.06■■■■□ 3.04
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LIMCH1-211ENST00000509638 APBA2Q99767 749 aa34.06■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 COBLO75128 1261 aa34.05■■■■□ 3.04
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LIMCH1-211ENST00000509638 FOSBP53539 338 aa34.05■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 DPP9Q86TI2 863 aa34.05■■■■□ 3.04
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LIMCH1-211ENST00000509638 CUL5Q93034 780 aa34.05■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 SMC3Q9UQE7 1217 aa34.05■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 ESYT2A0FGR8 921 aa34.04■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 SMCO2A6NFE2 343 aa34.04■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 POTEB2H3BUK9 544 aa34.04■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 MAF1Q9H063 256 aa34.04■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 ZMYND12Q9H0C1 365 aa34.04■■■■□ 3.04
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LIMCH1-211ENST00000509638 CYP2B6P20813 491 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 UBE2SQ16763 222 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 USP17L6PQ6QN14 398 aa34.02■■■■□ 3.04
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LIMCH1-211ENST00000509638 FAM133AQ8N9E0 248 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 FOXD4L1Q9NU39 408 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 COL20A1Q9P218 1284 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 HOXC6P09630 235 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF792Q3KQV3 632 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 LRRC37A2A6NM11 1700 aa34.02■■■■□ 3.04
LIMCH1-211ENST00000509638 PIK3CDO00329 1044 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 MEIS2O14770 477 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 PRMT2P55345 433 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 NLRP5P59047 1200 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 SAMD3Q8N6K7 520 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 NPLOC4Q8TAT6 608 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 C6orf50Q9HD87 102 aa34.01■■■■□ 3.03
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC5A4Q9NY91 659 aa34.01■■■■□ 3.03
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LIMCH1-211ENST00000509638 ASTN1O14525 1302 aa33.99■■■■□ 3.03
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LIMCH1-211ENST00000509638 CCL14Q16627 93 aa33.97■■■■□ 3.03
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LIMCH1-211ENST00000509638 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
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LIMCH1-211ENST00000509638 GALNT17Q6IS24 598 aa33.94■■■■□ 3.02
LIMCH1-211ENST00000509638 DNERQ8NFT8 737 aa33.94■■■■□ 3.02
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LIMCH1-211ENST00000509638 TMEM260Q9NX78 707 aa33.94■■■■□ 3.02
LIMCH1-211ENST00000509638 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
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