RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 MZB1Q8WU39 189 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 COPS5Q92905 334 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 KCTD3Q9Y597 815 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 IRAK3Q9Y616 596 aa6.71□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 SRGAP3O43295 1099 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 CYBBP04839 570 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 MAPKAPK2P49137 400 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 CDR1P51861 262 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 SSPNQ14714 243 aa6.7□□□□□ -1.34
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UBE2B-203ENST00000503080 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 GMLQ99445 158 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 CLEC1BQ9P126 229 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 F8W031 263 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 SUSD5O60279 629 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 PLS3P13797 630 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 NCKAP1LP55160 1127 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 FBLN7Q53RD9 439 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 LZTR1Q8N653 840 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 PANK1Q8TE04 598 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 GULP1Q9UBP9 304 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 C7orf72A4D263 438 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 TBX1O43435 398 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 GJB6O95452 261 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ITGAVP06756 1048 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 THBDP07204 575 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 GLI4P10075 376 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 PI3P19957 117 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ST7Q9NRC1 585 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 RFXAPO00287 272 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 NPHS1O60500 1241 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 PRR5P85299 388 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 MBLAC2Q68D91 279 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 CABP7Q86V35 215 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 USP33Q8TEY7 942 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 MMP19Q99542 508 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 MTA3Q9BTC8 594 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.67□□□□□ -1.34
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UBE2B-203ENST00000503080 CYP4F3Q08477 520 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 FRS2Q8WU20 508 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 FUCA1P04066 466 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 HOXC12P31275 282 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 ECI1P42126 302 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 INF2Q27J81 1249 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-203ENST00000503080 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.342e-8■■■■□ 24.5
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UBE2B-203ENST00000503080 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 FAM129CQ86XR2 697 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 NETO2Q8NC67 525 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2B-203ENST00000503080 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 AGRPO00253 132 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 NTRK1P04629 796 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 PFKLP17858 780 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 KCNJ6P48051 423 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-203ENST00000503080 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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