RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 GPR160Q9UJ42 338 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 PAPLNO95428 1278 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 EFEMP2O95967 443 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ITGB5P18084 799 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 SNX17Q15036 470 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 TESK1Q15569 626 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MBLAC2Q68D91 279 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 NLRX1Q86UT6 975 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC103Q8IW40 242 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 DIO2Q92813 273 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ASIC4Q96FT7 647 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 RNF32Q9H0A6 362 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PQ27 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PQ64 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PQC6 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PQD8 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 BLACEA4D250 179 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 C7orf72A4D263 438 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 NPHS1O60500 1241 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 LTBRP36941 435 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 KCNAB2Q13303 367 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 SQSTM1Q13501 440 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 KIR3DS1Q14943 382 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 NTRK3Q16288 839 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 INF2Q27J81 1249 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 USP53Q70EK8 1073 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 NUP43Q8NFH3 380 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 SHISA4Q96DD7 197 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 PRKCAP17252 672 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 GALK1P51570 392 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MVKQ03426 396 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 KCNMB1Q16558 191 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 MCTP1Q6DN14 999 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 DCAF4Q8WV16 495 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GLI1P08151 1106 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MSL3P1P0C860 447 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CORO7P57737 925 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 FAM168AQ92567 244 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 DPF3Q92784 378 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM260Q9NX78 707 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GULP1Q9UBP9 304 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TBX22Q9Y458 520 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ESYT3A0FGR9 886 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TLDC2A0PJX2 215 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 LCP1P13796 627 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PNLIPP16233 465 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CYP4F8P98187 520 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GPR27Q9NS67 375 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MYO1BO43795 1136 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ARL4AP40617 200 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 STYK1Q6J9G0 422 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 LZTR1Q8N653 840 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PTPRN2Q92932 1015 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 BTG4Q9NY30 223 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PQJ5 194 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TACR1P25103 407 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GTF2A2P52657 109 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GABREP78334 506 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 HOMER1Q86YM7 354 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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