RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF174	Q15697	407 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565		Q4G0T1	1027 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	SHC4	Q6S5L8	630 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	CPVL	Q9H3G5	476 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.65	□□□□□ -0.7
LPIN3-204	ENST00000496565	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.65	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A1B0GVL5	298 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	SYCE3	A1L190	88 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	POTEC	B2RU33	542 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	VWA5A	O00534	786 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	IRF6	O14896	467 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	MAFG	O15525	162 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	FLOT1	O75955	427 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	SLFN14	P0C7P3	912 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	MUT	P22033	750 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	MCM7	P33993	719 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	HSD17B4	P51659	736 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	NDUFA8	P51970	172 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	VGLL4	Q14135	290 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	MTMR9	Q96QG7	549 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565		B4DLN1	442 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	STAM2	O75886	525 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	SMC2	O95347	1197 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	BCR	P11274	1271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	UBA7	P41226	1012 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	AMPD3	Q01432	767 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CALCRL	Q16602	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP350	Q5VT06	3117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP1R2	P41236	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	STX1A	Q16623	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CALML4	Q96GE6	196 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF536	O15090	1300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	ADM5	C9JUS6	153 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	MARCH6	O60337	910 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC25A27	O95847	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	OSBP	P22059	807 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LPIN3-204	ENST00000496565	HMGCS2	P54868	508 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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