RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496253.1

MFSD9-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 9, human

TSL 2

Gene MFSD9, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD9-208	ENST00000496253	EPHB4	P54760	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CCL23	P55773	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GJA9	P57773	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	COPS5	Q92905	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KRT23	Q9C075	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ARVCF	O00192	962 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	B4GALT4	O60513	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PLA2G6	O60733	806 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FGR	P09769	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CYP2C9	P11712	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FOSL2	P15408	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CPT1A	P50416	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PTH1R	Q03431	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	WTAP	Q15007	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SCLY	Q96I15	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ABCB11	O95342	1321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	COL6A3	P12111	3177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MYO9B	Q13459	2157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253		B4DLN1	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CTAGE5	O15320	804 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CABYR	O75952	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ARIH2	O95376	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TIMP1	P01033	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RXRA	P19793	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DNAJB2	P25686	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CHML	P26374	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PBX2	P40425	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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