RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 RASGRP1O95267 797 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 GDF11O95390 407 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB2P05107 769 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 JMJD7P0C870 316 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 FOSL1P15407 271 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 JAMLQ86YT9 394 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CREG2Q8IUH2 290 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 NAT16Q8N8M0 369 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ASB11Q8WXH4 323 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PTCHD1Q96NR3 888 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ALG1Q9BT22 464 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 WASH4PA8MWX3 477 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ALG1L2C9J202 215 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PMLP29590 882 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 DOC2BQ14184 412 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF460Q14592 562 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ATL2Q8NHH9 583 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 MYO1BO43795 1136 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 FKTNO75072 461 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PDGFRBP09619 1106 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 EGR3Q06889 387 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 DHCR24Q15392 516 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 KIZQ2M2Z5 673 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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PTPRC-212ENST00000491302 CCDC103Q8IW40 242 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 WNK4Q96J92 1243 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CEP89Q96ST8 783 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 FAM83GA6ND36 823 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ARVCFO00192 962 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 KPNA6O60684 536 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2A2P52657 109 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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PTPRC-212ENST00000491302 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 TEKQ02763 1124 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRC-212ENST00000491302 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 KIF18BQ86Y91 864 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 MISP3Q96FF7 219 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 MTFR1LQ9H019 292 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 VAV3Q9UKW4 847 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 GSTA4O15217 222 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 BRINP1O60477 761 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 ESR1P03372 595 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCQQ04759 706 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3R6Q5UE93 754 aa10.58□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.58□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 LAPTM5Q13571 262 aa10.57□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 PANK1Q8TE04 598 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 MSCO60682 206 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 EYA4O95677 639 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 S100BP04271 92 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 LCP1P13796 627 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 KCNA6P17658 529 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 SCNN1BP51168 640 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 STRN3Q13033 797 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 AOC3Q16853 763 aa10.56□□□□□ -0.72
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