RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 DIO2Q92813 273 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 AQP7O14520 342 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 IRAK1P51617 712 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 NIM1KQ8IY84 436 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CCDC120Q96HB5 630 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MAP6Q96JE9 813 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 GPR27Q9NS67 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 NAT1P18440 290 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CCDC103Q8IW40 242 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MFSD3Q96ES6 412 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ARNTLO00327 626 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 APPP05067 770 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 GPR85P60893 370 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 LAPTM5Q13571 262 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CBLL1Q75N03 491 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ASXL2Q76L83 1435 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MYO1BO43795 1136 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CHRNEQ04844 493 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 TM4SF20Q53R12 229 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 BRAPQ7Z569 592 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 JAMLQ86YT9 394 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 SPC25Q9HBM1 224 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PQY0 241 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 NPHS1O60500 1241 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC6O75061 913 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MASP1P48740 699 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 INF2Q27J81 1249 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MBLAC2Q68D91 279 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 EBF1Q9UH73 591 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 C7orf72A4D263 438 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 CRTAMO95727 393 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 LCP1P13796 627 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 GTF2A2P52657 109 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 HK2P52789 917 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 RTP1P59025 263 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 GUCY1A3Q02108 690 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 KIZQ2M2Z5 673 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 LBX2Q6XYB7 198 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCL20-204ENST00000489160 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.09□□□□□ -1.27
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