RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TRIML1Q8N9V2 468 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PAK1Q13153 545 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SEC23AQ15436 765 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PTPROQ16827 1216 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NFU1Q9UMS0 254 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 STX8Q9UNK0 236 aa18■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087X0B3 334 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 AKR1B10O60218 316 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 KCNG1Q9UIX4 513 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 GDAQ9Y2T3 454 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BIRC2Q13490 618 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NCK2O43639 380 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 LSP1P33241 339 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PKN1Q16512 942 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MYH15Q9Y2K3 1946 aa17.99■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 GUCY2DQ02846 1103 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SNCBQ16143 134 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 LRWD1Q9UFC0 647 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TACC1O75410 805 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 GCKP35557 465 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NAA35Q5VZE5 725 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TYW1BQ6NUM6 668 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PLCD4Q9BRC7 762 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.98■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GUA9 196 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BUB1O43683 1085 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MOCS3O95396 460 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 DPYDQ12882 1025 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 PTGDRQ13258 359 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZIM3Q96PE6 472 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MKNK2Q9HBH9 465 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 DOT1LQ8TEK3 1739 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 STK36Q9NRP7 1315 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L3A6NCW0 530 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L4A6NCW7 530 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 USO1O60763 962 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TFAP4Q01664 338 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG1Q07617 926 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TTMPQ5BVD1 217 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 VAT1LQ9HCJ6 419 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 HAUS2Q9NVX0 235 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 B4DLN1 442 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NR1D1P20393 614 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SATB1Q01826 763 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 CCT8L2Q96SF2 557 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SLC40A1Q9NP59 571 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 RTL9Q8NET4 1388 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 EP400Q96L91 3159 aa17.97■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 GRIK5Q16478 980 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MYH2Q9UKX2 1941 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 SARNPP82979 210 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TROAPQ12815 778 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 NFIXQ14938 502 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TCP11X2Q5H9J9 407 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TTC38Q5R3I4 469 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms