RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480316.1

FLCN-209, Transcript of folliculin, human

TSL 2

Gene FLCN, Length 786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FLCN-209	ENST00000480316	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	TNKS	O95271	1327 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	CTAGE5	O15320	804 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	ITGB8	P26012	769 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	PDE4A	P27815	886 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	PDE4D	Q08499	809 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	USH1G	Q495M9	461 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	MYH6	P13533	1939 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	ABCB11	O95342	1321 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FLCN-209	ENST00000480316	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	ERICH2	A1L162	156 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CPT1A	P50416	773 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27	1e-7	■□□□□ 8.8
FLCN-209	ENST00000480316	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CHML	P26374	656 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	KPNA6	O60684	536 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CD4	P01730	458 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	EDNRB	P24530	442 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	EPHB4	P54760	987 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	TRAF1	Q13077	416 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	IL25	Q9H293	177 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SGSM2	O43147	1006 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	MYL3	P08590	195 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CYP21A2	P08686	494 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SEC23A	Q15436	765 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	CSF2RA	P15509	400 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PTGS1	P23219	599 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PSMC6	P62333	389 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	PTH1R	Q03431	593 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	WTAP	Q15007	396 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	STXBP2	Q15833	593 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FLCN-209	ENST00000480316	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27

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