RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PRKCZQ05513 592 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 MAP2K5Q13163 448 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 FGD4Q96M96 766 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 COL20A1Q9P218 1284 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 SRRDQ9UH36 339 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 GABRQQ9UN88 632 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PGK2P07205 417 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 SMCO2A6NFE2 343 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CFBP00751 764 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 GJB2P29033 226 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 FLT3LGP49771 235 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 IGHA2P01877 340 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 POLR2MP0CAP2 368 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 ADCY7P51828 1080 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CNTN2Q02246 1040 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF6Q15052 776 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CUL5Q93034 780 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 POTEB2H3BUK9 544 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 CALML3P27482 149 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 HOXD10P28358 340 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 IRF5Q13568 498 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 UBE2SQ16763 222 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 APBA2Q99767 749 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 TRIM17Q9Y577 477 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 M0R2N6 131 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 RGS2P41220 211 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PRMT2P55345 433 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 NLRP5P59047 1200 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 BECN1Q14457 450 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 KRT40Q6A162 431 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 C6orf50Q9HD87 102 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-210ENST00000477812 XBP1P17861 261 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 GNA11P29992 359 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 GALNT17Q6IS24 598 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 MAML3Q96JK9 1138 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 C8orf76Q96K31 380 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 RPTORQ8N122 1335 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 MMP1P03956 469 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 CYP2B6P20813 491 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 FOSBP53539 338 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 DPP9Q86TI2 863 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 KIF3AQ9Y496 699 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 CCL14Q16627 93 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 DNERQ8NFT8 737 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 OXER1Q8TDS5 423 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 TNFRSF25Q93038 417 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 TMEM260Q9NX78 707 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 EDNRBP24530 442 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 GUCY1B3Q02153 619 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 AP3B2Q13367 1082 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-210ENST00000477812 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.86■■□□□ 1.25
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