RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476739.5

HDAC3-208, Transcript of histone deacetylase 3, human

TSL 3

Gene HDAC3, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC3-208	ENST00000476739	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	ADCY6	O43306	1168 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	PTGS1	P23219	599 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	GNAQ	P50148	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	EVC	P57679	992 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	ANAPC15	P60006	121 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	SEPT4	O43236	478 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	CFB	P00751	764 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	NID2	Q14112	1375 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	KIF2C	Q99661	725 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	ASB14	A6NK59	587 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	DTNB	O60941	627 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	HSD17B4	P51659	736 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	RCAN1	P53805	252 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	GHRHR	Q02643	423 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	STK3	Q13188	491 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	NTRK3	Q16288	839 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HDAC3-208	ENST00000476739	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	EDNRB	P24530	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	AK2	P54819	239 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	PHKB	Q93100	1093 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	MEIS2	O14770	477 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	MSC	O60682	206 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	LARGE1	O95461	756 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	PGK1	P00558	417 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	AKR1A1	P14550	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	NEK4	P51957	841 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	SCRN1	Q12765	414 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	PKN1	Q16512	942 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	MAF1	Q9H063	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC3-208	ENST00000476739	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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