RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.95■■□□□ 1.1
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MYADML2A6NDP7 307 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCM5P33992 734 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF20Q5VTR2 975 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 AMNQ9BXJ7 453 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LY9Q9HBG7 655 aa21.94■■□□□ 1.1
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PRC1O43663 620 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDAH1O94760 285 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 EDNRBP24530 442 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNA10Q16322 511 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.93■■□□□ 1.1
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TLK2Q86UE8 772 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM87BQ96K49 555 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 B4DLN1 442 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTAGE5O15320 804 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMPD1P17405 629 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRAPPC10-208ENST00000469521 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRAPPC10-208ENST00000469521 Q9Y3F1 56 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.91■■□□□ 1.1
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TRAPPC10-208ENST00000469521 GHRHRQ02643 423 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDE4DQ08499 809 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAF1Q13077 416 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GNASQ5JWF2 1037 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMA3Q16787 3333 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ELP1O95163 1332 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASGR1P07306 291 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMTC2Q8N394 836 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 LIFRP42702 1097 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 TLE2Q04725 743 aa21.89■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.89■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.88■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HOMER1Q86YM7 354 aa21.88■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TOX2Q96NM4 488 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIGSQ96S52 555 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.88■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 COL20A1Q9P218 1284 aa21.88■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CLTBP09497 229 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCFD2Q8WU76 684 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D5Q92609 795 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 IWS1Q96ST2 819 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 CABYRO75952 493 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 CALM1P0DP23 149 aa21.86■■□□□ 1.09
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