RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.48■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 ARVCFO00192 962 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 ZEB2O60315 1214 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 ANKS1AQ92625 1134 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 MYH6P13533 1939 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 FPGSQ05932 587 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 TRDNQ13061 729 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 MORC4Q8TE76 937 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-204ENST00000468807 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 CHMLP26374 656 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 CDK7P50613 346 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 NKX3-2P78367 333 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 PDE4DQ08499 809 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 FAM161BQ96MY7 647 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 EPHB4P54760 987 aa25.44■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.44■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 ABCB11O95342 1321 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 CABYRO75952 493 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 TIMP1P01033 207 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 PTH1RQ03431 593 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 TBX21Q9UL17 535 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 Q9Y3F1 56 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.42■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.42■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.42■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.42■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 B4DLN1 442 aa25.41■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 ITGA7Q13683 1181 aa25.41■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.41■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 DNERQ8NFT8 737 aa25.41■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.41■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 CYP21A2P08686 494 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 PSMC6P62333 389 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 PPP2R5BQ15173 497 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 FBXO11Q86XK2 927 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 TBC1D5Q92609 795 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 SEC23AQ15436 765 aa25.39■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 MFSD5Q6N075 450 aa25.39■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.39■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 RGS22Q8NE09 1264 aa25.39■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.39■■□□□ 1.66
TTC28-204ENST00000468807 ERICH2A1L162 156 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 SGSM2O43147 1006 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 MYL3P08590 195 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 EDNRBP24530 442 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 CPT1AP50416 773 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 TMEM199Q8N511 208 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 KLRF2D3W0D1 207 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 CD4P01730 458 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.652e-7■■■□□ 15.2
TTC28-204ENST00000468807 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 SCFD2Q8WU76 684 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 GRIN2DO15399 1336 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 E7EWF7 191 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 CSF2RAP15509 400 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 CYP2C18P33260 490 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 CHST3Q7LGC8 479 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 NCOA7Q8NI08 942 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 COPS5Q92905 334 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 CFBP00751 764 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 WTAPQ15007 396 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 HOMER1Q86YM7 354 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 RMDN3Q96TC7 470 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.653e-7■■□□□ 13.6
TTC28-204ENST00000468807 AMNQ9BXJ7 453 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC28-204ENST00000468807 HIPK3Q9H422 1215 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms