RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CERS5Q8N5B7 392 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 USP40Q9NVE5 1235 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TRIM37O94972 964 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ADCY7P51828 1080 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TERF2Q15554 542 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CDC23Q9UJX2 597 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 G3V3G9 751 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 LAD1O00515 517 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 MARCH6O60337 910 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PRPHP41219 470 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TCP10Q12799 353 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CYP27A1Q02318 531 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 THAP9Q9H5L6 903 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SRGAP2O75044 1071 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TRIM14Q14142 442 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 WDR59Q6PJI9 974 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SLF2Q8IX21 1173 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 MYMKA6NI61 221 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 BBOX1O75936 387 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TBC1D8O95759 1140 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 GRB10Q13322 594 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CCNE1P24864 410 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SV2BQ7L1I2 683 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 KCNK18Q7Z418 384 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 KIAA1328Q86T90 577 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CERKQ8TCT0 537 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 RABGGTAQ92696 567 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 AK8Q96MA6 479 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PNKPQ96T60 521 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 AFF2P51816 1311 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 USP17L10C9JJH3 530 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SNAP25P60880 206 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 NFIAQ12857 509 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS3-202ENST00000460120 GYS2P54840 703 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 PNMA5Q96PV4 448 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 GAKO14976 1311 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 RASSF10A6NK89 507 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 HERVK_113P62684 666 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 DNM2P50570 870 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 EDIL3O43854 480 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 HINFPQ9BQA5 517 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 RCCD1A6NED2 376 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 SRGNP10124 158 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 FECHP22830 423 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 AMPD3Q01432 767 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS3-202ENST00000460120 ECM1Q16610 540 aa20.25■□□□□ 0.83
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