RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	TNFAIP2	Q03169	654 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL20A1	Q9P218	1284 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHF24	Q9UPV7	400 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	BEX3	Q00994	111 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	KCNA10	Q16322	511 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTMR8	Q96EF0	704 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627		A0A1W2PQY0	241 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZBTB5	O15062	677 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMPD1	P17405	629 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM60	Q495X7	471 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	MORC4	Q8TE76	937 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC69	A6NI79	296 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	OPLAH	O14841	1288 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	RNF20	Q5VTR2	975 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	NEK1	Q96PY6	1258 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	AMN	Q9BXJ7	453 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	CTAGE5	O15320	804 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	CFB	P00751	764 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	ACLY	P53396	1101 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	GJA9	P57773	515 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMEM87B	Q96K49	555 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	VTA1	Q9NP79	307 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SH3BP5-208	ENST00000459627	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	CPA1	P15085	419 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDE4D	Q08499	809 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	RGS22	Q8NE09	1264 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRO3102	Q9H379	93 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDAH1	O94760	285 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	TLK2	Q86UE8	772 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	ASGR1	P07306	291 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	GDF15	Q99988	308 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPC25	Q9HBM1	224 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	EDNRB	P24530	442 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	TLE2	Q04725	743 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	DNER	Q8NFT8	737 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTA3	Q9BTC8	594 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	LIFR	P42702	1097 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	SNX17	Q15036	470 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	COPS5	Q92905	334 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	RMDN3	Q96TC7	470 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	MICU3	Q86XE3	530 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMTC2	Q8N394	836 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SH3BP5-208	ENST00000459627	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	KIF5B	P33176	963 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARIH2	O95376	493 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	HSD17B4	P51659	736 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02

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