RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 ABCB11O95342 1321 aa21.96■■□□□ 1.11
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CCDC78-204ENST00000439619 TMEM199Q8N511 208 aa21.9■■□□□ 1.1
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CCDC78-204ENST00000439619 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 CASC1Q6TDU7 716 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 HIPK3Q9H422 1215 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC78-204ENST00000439619 GRM4Q14833 912 aa21.84■■□□□ 1.09
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