RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCM3APO60318 1980 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS6KB1P23443 525 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAF1Q9H063 256 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNM1LO00429 736 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNAQP50148 359 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZUG5 572 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCF2L2Q86YR7 1114 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HTATIP2Q9BUP3 242 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PGK1P00558 417 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GHRHRQ02643 423 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC41Q15345 812 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARRDC4Q8NCT1 418 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNERQ8NFT8 737 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDGFCQ9NRA1 345 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EDNRBP24530 442 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMA5P28066 241 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPF3Q92784 378 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYH6P13533 1939 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB43O43298 467 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAMTS4O75173 837 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSD17B4P51659 736 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APOBRQ0VD83 1088 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXL16Q8N461 479 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFBP00751 764 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADCYAP1R1P41586 468 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRF1Q92994 677 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTGS1P23219 599 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGD1P98174 961 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FUT2Q10981 343 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RUFY3Q7L099 469 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VTA1Q9NP79 307 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFAIP2Q03169 654 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAF1Q13077 416 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTN1Q16799 776 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYADML2A6NDP7 307 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KBTBD13C9JR72 458 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC24BO95487 1268 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMPD1P17405 629 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC27P30260 824 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCAN1P53805 252 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RMDN3Q96TC7 470 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE4DQ08499 809 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF180Q86T96 592 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.89■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALPK3Q96L96 1907 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTAGE5O15320 804 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EVI5O60447 810 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJA9P57773 515 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQSEC1Q6DN90 963 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF24Q9UPV7 400 aa28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms