RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 TRAF1Q13077 416 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 RUFY3Q7L099 469 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 MAF1Q9H063 256 aa20.89■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.88■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 KATNBL1Q9H079 304 aa20.88■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.88■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 OPLAHO14841 1288 aa20.87■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 FBXL16Q8N461 479 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 DNERQ8NFT8 737 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 MORC4Q8TE76 937 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.87■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 SEC24BO95487 1268 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 RCAN1P53805 252 aa20.86■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 COL20A1Q9P218 1284 aa20.86■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.85■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.85■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 DNM1LO00429 736 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 CDC27P30260 824 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 HSD17B4P51659 736 aa20.84■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 ANAPC15P60006 121 aa20.84■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 VTA1Q9NP79 307 aa20.84■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 C8orf34Q49A92 452 aa20.83■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.83■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.83■□□□□ 0.93
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
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HERC3-205ENST00000426683 ADCY6O43306 1168 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 COL6A1P12109 1028 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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HERC3-205ENST00000426683 LRRC41Q15345 812 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 DPF3Q92784 378 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS4O75173 837 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 EVCP57679 992 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 RNF180Q86T96 592 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 NID2Q14112 1375 aa20.81■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 MCM3APO60318 1980 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.8■□□□□ 0.92
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