RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TTC6Q86TZ1 520 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 FERMT3Q86UX7 667 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 MICU3Q86XE3 530 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TEX11Q8IYF3 940 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 C8orf76Q96K31 380 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 NACC1Q96RE7 527 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 FOCADQ5VW36 1801 aa6.99□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 USP17L3A6NCW0 530 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 USP17L4A6NCW7 530 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 YDJCA8MPS7 323 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 FIBPO43427 364 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 PRDM1O75626 825 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 DPEP1P16444 411 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RXRAP19793 462 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.292e-33■□□□□ 9.4
C6orf48-208ENST00000395788 MSX1P28360 303 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CRKP46108 304 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CDK8P49336 464 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 FZD5Q13467 585 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC93Q567U6 631 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 SOGA3Q5TF21 947 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 WASF1Q92558 559 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TEKT1Q969V4 418 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 GMLQ99445 158 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ALG1Q9BT22 464 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 MYL10Q9BUA6 226 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 MXD3Q9BW11 206 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 IDI2Q9BXS1 227 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 MTFR1LQ9H019 292 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 EHD4Q9H223 541 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TOMM22Q9NS69 142 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP45Q9UL16 551 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 SCN9AQ15858 1988 aa6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 C21orf2O43822 256 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 DEXIO95424 95 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ELNP15502 786 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TFAP4Q01664 338 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 PKN1Q16512 942 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 AOC3Q16853 763 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 KRT40Q6A162 431 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 PHKBQ93100 1093 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 PGBD1Q96JS3 809 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 AIFM3Q96NN9 605 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 PSME4Q14997 1843 aa6.97□□□□□ -1.29
C6orf48-208ENST00000395788 COL4A5P29400 1685 aa6.96□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms