RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DNM1LO00429 736 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PGK1P00558 417 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CALM1P0DP23 149 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CALM2P0DP24 149 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CALM3P0DP25 149 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PTGS1P23219 599 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC41Q15345 812 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TMTC3Q6ZXV5 915 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RGS22Q8NE09 1264 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DPF3Q92784 378 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PDGFCQ9NRA1 345 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS4O75173 837 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CFBP00751 764 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RPS6KB1P23443 525 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EDNRBP24530 442 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ADCYAP1R1P41586 468 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM63BQ5T3F8 832 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TAPT1Q6NXT6 567 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZUG5 572 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FANCBQ8NB91 859 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TAAR1Q96RJ0 339 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MYADML2A6NDP7 307 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GNAQP50148 359 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 APOBRQ0VD83 1088 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MCF2L2Q86YR7 1114 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC82Q8N4S0 544 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ARRDC4Q8NCT1 418 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DNERQ8NFT8 737 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 BRF1Q92994 677 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LZTS2Q9BRK4 669 aa17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KBTBD13C9JR72 458 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB43O43298 467 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PSMA5P28066 241 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCA1P28370 1054 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HSD17B4P51659 736 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GHRHRQ02643 423 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC26Q2I0M4 334 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MAF1Q9H063 256 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 VTA1Q9NP79 307 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SMPD1P17405 629 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CDC27P30260 824 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FGD1P98174 961 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RTN1Q16799 776 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KLHDC9Q8NEP7 349 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 H0YGN5 161 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EVI5O60447 810 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TNFAIP2Q03169 654 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PDE4DQ08499 809 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FUT2Q10981 343 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RNF180Q86T96 592 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf61Q8IZ16 206 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FERMT2Q96AC1 680 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CTAGE5O15320 804 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SEC24BO95487 1268 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GJA9P57773 515 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RUFY3Q7L099 469 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL16Q8N461 479 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RMDN3Q96TC7 470 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PXMP2Q9NR77 195 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PHF24Q9UPV7 400 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms