RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SPNS2-201ENST00000329078 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 MTA3Q9BTC8 594 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TRAPPC10P48553 1259 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ADSSL1Q8N142 457 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 EHD4Q9H223 541 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TDP2O95551 362 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TCP10Q12799 353 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 NARFQ9UHQ1 456 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 RNF40O75150 1001 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LDHCP07864 332 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SNAP25P60880 206 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 BRD3Q15059 726 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 DGKHQ86XP1 1220 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 RASA1P20936 1047 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 RRAGAQ7L523 313 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 NEK8Q86SG6 692 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 STXBP3O00186 592 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CACNB3P54284 484 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC15Q8TF66 581 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 BUB1O43683 1085 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CALCRLQ16602 461 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 KCTD1Q719H9 257 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 MMS19Q96T76 1030 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 BARHL2Q9NY43 387 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 KRT86O43790 486 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 KIF5AQ12840 1032 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 DOK7Q18PE1 504 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 COL4A1P02462 1669 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 IVLP07476 585 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 C2orf54Q08AI8 447 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ICE2Q659A1 982 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SV2BQ7L1I2 683 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 P2RX5Q93086 422 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LGALS16A8MUM7 142 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ATP8B1O43520 1251 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 GNA11P29992 359 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SLC20A2Q08357 652 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 GRM4Q14833 912 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CLGNO14967 610 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 PBX1P40424 430 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CCT5P48643 541 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 GPSM2P81274 684 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 EHD2Q9NZN4 543 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 GSTO1P78417 241 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC181Q5TID7 509 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC31Q6UY01 552 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC51Q96ER9 411 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SAMM50Q9Y512 469 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SLC7A5Q01650 507 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM9Q9C026 710 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TRAF5O00463 557 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 SEMA3EO15041 775 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP25P42331 645 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 EPS15P42566 896 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 TMC4Q7Z404 712 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 L1RE1Q9UN81 338 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 MYH3P11055 1940 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 LRP6O75581 1613 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-201ENST00000329078 RCCD1A6NED2 376 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms