RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 PSME4Q14997 1843 aa25.7■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.7■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 POTEMA6NI47 508 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 KCNJ18B7U540 433 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L15C9J2P7 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L11C9JVI0 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L18D6R9N7 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L22D6RA61 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L19D6RCP7 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L20D6RJB6 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 STX10O60499 249 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 NDUFB10O96000 172 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 SPDYE6P0CI01 402 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 SPAG1Q07617 926 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L24Q0WX57 530 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 KCNJ12Q14500 433 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PDIA5Q14554 519 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PNMA5Q96PV4 448 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PSMD1Q99460 953 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 H7C1D1 291 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CCP110O43303 1012 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ASIC1P78348 528 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 AMPD3Q01432 767 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GMCL1Q96IK5 515 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 RAB34Q9BZG1 259 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PSMD14O00487 310 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 STIM1Q13586 685 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 KIF18AQ8NI77 898 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 COL4A5P29400 1685 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CLRN2A0PK11 232 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 N4BP3O15049 544 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 KCNA3P22001 575 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PDE4DQ08499 809 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 RBL2Q08999 1139 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 HAS1Q92839 578 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 VPS16Q9H269 839 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 EXOC1Q9NV70 894 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.67■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PSMA7O14818 248 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 DPEP1P16444 411 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 SNAP25P60880 206 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GMLQ99445 158 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 STK17AQ9UEE5 414 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 SV2BQ7L1I2 683 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 GJA10Q969M2 543 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PRG0 241 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 PANX2Q96RD6 677 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 STK4Q13043 487 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 MCM6Q14566 821 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 DLGAP5Q15398 846 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 KRT79Q5XKE5 535 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SNX18-201ENST00000326277 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
SNX18-201ENST00000326277 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.64■■□□□ 1.69
SNX18-201ENST00000326277 TTI2Q6NXR4 508 aa25.64■■□□□ 1.69
SNX18-201ENST00000326277 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.64■■□□□ 1.69
SNX18-201ENST00000326277 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
SNX18-201ENST00000326277 AMNQ9BXJ7 453 aa25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms