RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 CTAGE5O15320 804 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 TIMP1P01033 207 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 PDE4DQ08499 809 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 USH1GQ495M9 461 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 DNERQ8NFT8 737 aa23.61■■□□□ 1.37
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TTC9B-201ENST00000311308 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 MAF1Q9H063 256 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 MCM3APO60318 1980 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 ITGB8P26012 769 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.6■■□□□ 1.37
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TTC9B-201ENST00000311308 RGS22Q8NE09 1264 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 TBX21Q9UL17 535 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 ABCB11O95342 1321 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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TTC9B-201ENST00000311308 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 MFSD5Q6N075 450 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC9B-201ENST00000311308 LAMA4Q16363 1823 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 ITGA7Q13683 1181 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 PPP2R5BQ15173 497 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM199Q8N511 208 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 SCFD2Q8WU76 684 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 CPVLQ9H3G5 476 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 ERICH2A1L162 156 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 CHMLP26374 656 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 FBXO11Q86XK2 927 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 IL25Q9H293 177 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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TTC9B-201ENST00000311308 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.55■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.55■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 EPHB4P54760 987 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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TTC9B-201ENST00000311308 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 CD4P01730 458 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 TTLL4Q14679 1199 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 FAM161BQ96MY7 647 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.53■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 KPNA6O60684 536 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 CYP21A2P08686 494 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 PTGS1P23219 599 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 TRAF1Q13077 416 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 SEC23AQ15436 765 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 NCOA7Q8NI08 942 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 AMNQ9BXJ7 453 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 HIPK3Q9H422 1215 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC9B-201ENST00000311308 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 KLRF2D3W0D1 207 aa23.51■■□□□ 1.35
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TTC9B-201ENST00000311308 MYL3P08590 195 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 IWS1Q96ST2 819 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 CSF2RAP15509 400 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 PSMC6P62333 389 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 PTH1RQ03431 593 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 RMDN3Q96TC7 470 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 WTAPQ15007 396 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC9B-201ENST00000311308 STXBP2Q15833 593 aa23.49■■□□□ 1.35
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