RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 ZPR1O75312 459 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 NTSR2O95665 410 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PRDX5P30044 214 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 LETM2Q2VYF4 491 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 KCTD16Q68DU8 428 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PNMA1Q8ND90 353 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MS4A14Q96JA4 679 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TRIM9Q9C026 710 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 BCL9O00512 1426 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 USP17L3A6NCW0 530 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 USP17L4A6NCW7 530 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 BUB1O43683 1085 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TECP42680 631 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 KIF11P52732 1056 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PPARDQ03181 441 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PDE4CQ08493 712 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PPFIA1Q13136 1202 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC181Q5TID7 509 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 IQCEQ6IPM2 695 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 RRAGAQ7L523 313 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 RETREG2Q8NC44 543 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TRIM58Q8NG06 486 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 BICDL2A1A5D9 508 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 EBAG9O00559 213 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CYTH3O43739 400 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CAMTA2O94983 1202 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ATP1A2P50993 1020 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 SH2D4AQ9H788 454 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 COL4A1P02462 1669 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 M0R2N6 131 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ATP6V1AP38606 617 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MAGEA1P43355 309 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 RASSF7Q02833 373 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ERFEQ4G0M1 354 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TMC4Q7Z404 712 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ESYT3A0FGR9 886 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PDCLQ13371 301 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 UBE4AQ14139 1066 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 VWA3BQ502W6 1294 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 TTMPQ5BVD1 217 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 DYMQ7RTS9 669 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 RUFY1Q96T51 708 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 STX8Q9UNK0 236 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 LRP5O75197 1615 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 MYH10P35580 1976 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 FLT1P17948 1338 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 LRRC53A6NM62 1247 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 ZEB2O60315 1214 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 KRT14P02533 472 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 OR52Z1P0C646 297 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PAFAH1B1P43034 410 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF3-202ENST00000299667 PARP10Q53GL7 1025 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms