RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290178.4

PAXBP1-201, Transcript of PAX3 and PAX7 binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PAXBP1, Length 2,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1-201ENST00000290178 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 SRGNP10124 158 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 MCM6Q14566 821 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 DYMQ7RTS9 669 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 GJA10Q969M2 543 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 POTEMA6NI47 508 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 NOVP48745 357 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 DNM2P50570 870 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 CALCRLQ16602 461 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 MTMR9Q96QG7 549 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 PNKPQ96T60 521 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1-201ENST00000290178 ENC1O14682 589 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 HERVK_113P62684 666 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SLF2Q8IX21 1173 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CEP112Q8N8E3 955 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CALML4Q96GE6 196 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 UIMC1Q96RL1 719 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 UBE2SQ16763 222 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 PNMA5Q96PV4 448 aa24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MYMKA6NI61 221 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 KIF20AO95235 890 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SMARCA1P28370 1054 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MIIPQ5JXC2 388 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CERS5Q8N5B7 392 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ADRA2BP18089 450 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ERCC3P19447 782 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SCNN1DP51172 638 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 GABPAQ06546 454 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 FUT8Q9BYC5 575 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SLC16A2P36021 539 aa24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ADCY7P51828 1080 aa24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SV2BQ7L1I2 683 aa24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ESYT2A0FGR8 921 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 BICDL2A1A5D9 508 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 TNNI2P48788 182 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 AMPD3Q01432 767 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ATP2B2Q01814 1243 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 RCCD1A6NED2 376 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 KCNK18Q7Z418 384 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MYO6Q9UM54 1294 aa24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 AMPD2Q01433 879 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 DOK7Q18PE1 504 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 USP40Q9NVE5 1235 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ATP8B1O43520 1251 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 IDEP14735 1019 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CYP27A1Q02318 531 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ECM1Q16610 540 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 MEA1Q16626 185 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 KCTD1Q719H9 257 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.2■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 CCDC151A5D8V7 595 aa24.2■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SRGAP2O75044 1071 aa24.2■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SNHG28P0DPA3 235 aa24.2■■□□□ 1.47
PAXBP1-201ENST00000290178 SEMA3FQ13275 785 aa24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms