RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 EBAG9O00559 213 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 DYMQ7RTS9 669 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.8□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 FAM205CA6NFA0 338 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 BBOX1O75936 387 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ACTN2P35609 894 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PSMD14O00487 310 aa9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 DNM3Q9UQ16 869 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FAM13AO94988 1023 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GYPCP04921 128 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 USP49Q70CQ1 688 aa9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CASP1P29466 404 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PRDX5P30044 214 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SPATA20Q8TB22 786 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PIGSQ96S52 555 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 NDST4Q9H3R1 872 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 TTLL1O95922 423 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FGRP09769 529 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ANKS1AQ92625 1134 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 LRRC45Q96CN5 670 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 C8orf37Q96NL8 207 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CENPHQ9H3R5 247 aa9.78□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.78□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 EPHB4P54760 987 aa9.78□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.78□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 PHACTR2O75167 634 aa9.78□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.78□□□□□ -0.84
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HERC3-201ENST00000264345 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ABCB11O95342 1321 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SERPING1P05155 500 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PPP4CP60510 307 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
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