RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 ATP8B1O43520 1251 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 TACC1O75410 805 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 111.5
TMOD1-201ENST00000259365 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM14Q14142 442 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 MAP9Q49MG5 647 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 BCL9O00512 1426 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 FAM196BA6NMK8 535 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 PAFAH1B1P43034 410 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 BTDP43251 543 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 CCT5P48643 541 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 CALCRLQ16602 461 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 C8orf37Q96NL8 207 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM9Q9C026 710 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TMOD1-201ENST00000259365 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC53A6NM62 1247 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 UFL1O94874 794 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 USP14P54578 494 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 NEK8Q86SG6 692 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 AMPD3Q01432 767 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MAP2K7O14733 419 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 CCNE1P24864 410 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 RFC4P35249 363 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SCNN1DP51172 638 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 CEP95Q96GE4 821 aa14.89□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 BICDL2A1A5D9 508 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 TRAPPC10P48553 1259 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 EHHADHQ08426 723 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf60Q5U649 245 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 TTI2Q6NXR4 508 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 NDST4Q9H3R1 872 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ATRNO75882 1429 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MEIS1O00470 390 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SEMA3EO15041 775 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 GNAQP50148 359 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 KIF11P52732 1056 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 KCTD1Q719H9 257 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 NGLY1Q96IV0 654 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MYH8P13535 1937 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 CDK8P49336 464 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 LIG3P49916 1009 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ZBED6P86452 979 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 KRT79Q5XKE5 535 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MYMKA6NI61 221 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 STXBP3O00186 592 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 ATP2C2O75185 946 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 TCP10Q12799 353 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 MXD3Q9BW11 206 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.87□□□□□ -0.03
TMOD1-201ENST00000259365 KLRC4O43908 158 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms