RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 RIMBP2O15034 1052 aa20.29■□□□□ 0.84
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PANX1-201ENST00000227638 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 CAGE1Q8TC20 777 aa20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 COG1Q8WTW3 980 aa20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 PNMA5Q96PV4 448 aa20.23■□□□□ 0.83
PANX1-201ENST00000227638 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.23■□□□□ 0.83
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