RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bco2Q99NF1 532 aa32.58■■■□□ 2.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr64Q9D565 1086 aa32.58■■■□□ 2.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mctp1E9PV86 951 aa32.57■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm5134E9QAB5 671 aa32.57■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NfibP97863 570 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Madcam1Q61826 405 aa32.57■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fyb2A2A995 729 aa32.56■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcdha4O88689 947 aa32.56■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SsbP32067 415 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cst8P32766 142 aa32.56■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp26Q99MX1 835 aa32.56■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa32.55■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mpp3O88910 568 aa32.55■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stat3P42227 770 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acat1Q8QZT1 424 aa32.55■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prg3Q9JL95 222 aa32.55■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa32.54■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Entpd3Q8BFW6 529 aa32.54■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clec11aO88200 328 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tfr2Q9JKX3 798 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmod4Q9JLH8 345 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nr1i2O54915 431 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc16a10Q3U9N9 512 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif5bQ61768 963 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp49Q6P9L4 685 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snrnp35Q9D384 244 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col11a1Q61245 1804 aa32.53■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gas2l3Q3UWW6 683 aa32.52■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc45a1Q8BIV7 751 aa32.52■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa32.52■■■□□ 2.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acad12D3Z7X0 555 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Esr2O08537 530 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pex1Q5BL07 1284 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pxylp1Q8BHA9 480 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcnv2Q8CFS6 562 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifih1Q8R5F7 1025 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sertad1Q9JL10 236 aa32.51■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zscan29E9Q5B4 869 aa32.5■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rps6P62754 249 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc26a4Q9R155 780 aa32.5■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 JcadQ5DTX6 1320 aa32.5■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt18P05784 423 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccnd3P30282 292 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lig1P37913 916 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dusp10Q9ESS0 483 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vav3Q9R0C8 847 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Serpina16D3Z660 418 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mroh8E9PYI4 1049 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp51Q3U4L8 781 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mtss1lQ6P9S0 715 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cog5Q8C0L8 829 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tm4sf4Q91XD3 202 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcdhb15Q91Y04 786 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Traf7Q922B6 594 aa32.49■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pnma5Q5DTT8 618 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf652Q5DU09 608 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccna1Q61456 421 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dusp9Q7TNL7 452 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ctdspl2Q8BG15 465 aa32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dicer1Q8R418 1916 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PgfP49764 158 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcif1P59114 706 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spryd7Q3TFQ1 196 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlgn2Q69ZK9 836 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep120Q7TSG1 988 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc24Q8BHA1 521 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mettl5Q8K1A0 209 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itm2cQ91VK4 269 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rassf3Q99P51 232 aa32.47■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Parp2O88554 559 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il4rP16382 810 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp11aP98197 1187 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc12a8Q8VI23 705 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stxbp4Q9WV89 557 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Btbd19S4R1I0 287 aa32.46■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Erbb2P70424 1256 aa32.45■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Extl2Q9ES89 330 aa32.45■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nap1l5Q9JJF0 156 aa32.45■■■□□ 2.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10134F6ZQC6 126 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bbs9Q811G0 885 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nipa1Q8BHK1 323 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ago4Q8CJF8 861 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 IrgqQ8VIM9 583 aa32.45■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r71L7N2D8 855 aa32.44■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HunkO88866 714 aa32.44■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tyro3P55144 880 aa32.44■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc27Q8CD92 847 aa32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms