RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcna1P16388 495 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aco1P28271 889 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep126Q0VBV7 1103 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esyt3Q5DTI8 891 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Havcr2Q8VIM0 281 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sall1Q9ER74 1322 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem265E9Q8G3 109 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prom1O54990 867 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pik3r1P26450 724 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MycbpapQ5SUV2 932 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Samhd1Q60710 627 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Casc1Q6TDU8 730 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fsd1Q7TPM6 496 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AllcQ9JHX6 414 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hic1Q9R1Y5 733 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sel1lQ9Z2G6 790 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fyb2A2A995 729 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cct2P80314 535 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrx1Q3TL44 975 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ece1Q4PZA2 769 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcaf8Q8N7N5 591 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc45Q9Z1X9 566 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mia3Q8BI84 1930 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AV320801A2AWL3 467 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm15023L7MUB4 467 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nedd1P33215 660 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col19a1Q0VF58 1136 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PolkQ9QUG2 852 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ggps1Q9WTN0 300 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mt-CybP00158 381 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nr5a1P33242 462 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kctd3Q8BFX3 815 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q8C5S3 137 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crlf2Q8CII9 359 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cchcr1Q8K2I2 770 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acat1Q8QZT1 424 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TbcbQ9D1E6 244 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scnn1bQ9WU38 638 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Foxp1P58462 705 aa26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A1cfQ5YD48 595 aa26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmc1Q8R4P5 757 aa26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pfkfb3A7UAK5 555 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TroapB7ZNG4 668 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tlk2O55047 718 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SfnO70456 248 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GlrbP48168 496 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cplx2P84086 134 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rusc1Q8BG26 893 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hdhd5Q91WM2 419 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plod3Q9R0E1 741 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HttP42859 3119 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan20B2KFW1 1030 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nap1l2P51860 460 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Meis2P97367 477 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Etaa1Q5SVT3 877 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ece2Q80Z60 881 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rufy2Q8R4C2 606 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc6G3UYY4 1857 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oip5A2AQ14 241 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp943Q6NZP4 507 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wbp1lQ8BGW2 348 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RadxQ8C779 850 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bud13Q8R149 637 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rassf3Q99P51 232 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc81Q9D5W4 654 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lamb2Q61292 1799 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcna2P63141 499 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gcnt1Q09324 428 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep63Q3UPP8 700 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PRAG1Q571I4 1179 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phlda1Q62392 405 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CerkQ8K4Q7 531 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plcd1Q8R3B1 756 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tesk2Q8VCT9 570 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tubb6Q922F4 447 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9DAQ4 598 aa26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms