RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif3j2Q66JS6 263 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sulf1Q8K007 870 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Acat1Q8QZT1 424 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vta1Q9CR26 309 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9DAQ4 598 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 SerhlQ9EPB5 311 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rexo5D3YW29 759 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Serpina16D3Z660 418 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc25aP48964 514 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 NfibP97863 570 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sun3Q5SS91 320 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 GypcQ78HU7 95 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Siglec10Q80ZE3 688 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 HlcsQ920N2 722 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rcan3Q9JKK0 239 aa18.16■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm5737A0A140LI11 423 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klhl34A2AI76 644 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rasa2P58069 847 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcif1P59114 706 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Map4k1P70218 827 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 BcrQ6PAJ1 1270 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pde5aQ8CG03 865 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vav3Q9R0C8 847 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 S1pr4Q9Z0L1 386 aa18.15■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zkscan7E9PVW1 718 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rsph10bE9PYQ0 876 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Akr1c19G3X9Y6 323 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc7a1Q09143 622 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 DaglbQ91WC9 669 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cabp7Q91ZM8 215 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krtap5-3Q9D226 196 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tfr2Q9JKX3 798 aa18.14■□□□□ 0.5
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc173A0JLY1 547 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Parp2O88554 559 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mpp3O88910 568 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rgl2Q61193 778 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r199Q8R280 367 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tubgcp2Q921G8 905 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mkrn1Q9QXP6 481 aa18.14■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fyb2A2A995 729 aa18.13■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rbm46P86049 533 aa18.13■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam83hQ148V8 1209 aa18.13■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Otud5Q3U2S4 566 aa18.13■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnf180Q3U827 592 aa18.13■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep128Q8BI22 1102 aa18.13■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nlrx1Q3TL44 975 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 RragbQ6NTA4 374 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Senp7Q8BUH8 1037 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 DnerQ8JZM4 737 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kdm4bQ91VY5 1086 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 BccipQ9CWI3 316 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fsip1Q9D3V5 435 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Col11a1Q61245 1804 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 CluhQ5SW19 1315 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r71L7N2D8 855 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcdha4O88689 947 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grik5Q61626 979 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ero1bQ8R2E9 467 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rfc4Q99J62 364 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt82Q99M74 516 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bco2Q99NF1 532 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fem1bQ9Z2G0 627 aa18.12■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plcg1Q62077 1302 aa18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 FlgP11088 336 aa18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tsen34Q8BMZ5 316 aa18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Caps2Q8BUG5 550 aa18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q91WD4 421 aa18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 PdgfdQ925I7 370 aa18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zscan25B2RX31 543 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc4a9E9PUP3 929 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mroh8E9PYI4 1049 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sdc2P43407 202 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 P2ry10Q8BFU7 328 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q8BZJ8 459 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Brms1Q99N20 246 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Filip1Q9CS72 1211 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 NapaQ9DB05 295 aa18.1■□□□□ 0.49
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lypla2Q9WTL7 231 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.4 ms