RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B APL1P27351 700 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ZIP1P31111 875 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B LDB7P38210 180 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MET30P39014 640 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SSN3P39073 555 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS52P39904 641 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR144WP40214 342 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YTA6P40328 754 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ALG8P40351 577 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B UTP25P40498 721 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B IME4P41833 600 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B NNF1P47149 201 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR012WP53206 393 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ALF1P53904 254 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SIW14P53965 281 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B VTA1Q06263 330 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B GRS2Q06817 618 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B AFT2Q08957 416 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR018CQ12185 396 aa3.02□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SEM1O94742 89 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PHO5P00635 467 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B STE12P13574 688 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ATE1P16639 503 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YCL049CP25577 312 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B HIR2P32480 875 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YME1P32795 747 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CTF13P35203 478 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ARN2P38724 620 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YHR045WP38775 560 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B DMA1P38823 416 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ERP2P39704 215 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B AZF1P41696 914 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YJL043WP47053 257 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RFX1P48743 811 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR003CP53394 754 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ESBP6P53918 673 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SOV1Q04748 898 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PIN3Q06449 215 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CIR2Q08822 631 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR056CQ12025 205 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B Q0144Q9ZZW2 109 aa3.01□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CLN2P20438 545 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B TSR4P25040 408 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B STP22P25604 385 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RPB9P27999 122 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MEI4P29467 408 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YMC1P32331 307 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B UTR2P32623 467 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B NIP100P33420 868 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SKT5P34226 696 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YBP1P38315 674 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PTH1P38876 190 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ICE2P40499 491 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B HOC1P47124 396 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YNL108CP53929 270 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ROY1Q04847 553 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B BLS1Q06071 122 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YLR001CQ07895 862 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B XYL2Q07993 356 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B AAD15Q08361 143 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B HRK1Q08732 759 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B GTT2Q12390 233 aa3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RPP2BP02400 110 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRB1P09232 635 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B OXP1P28273 1286 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ATS1P31386 333 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B DCG1P32460 244 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B QRI1P43123 477 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B OSW7P43611 510 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B IRC6P43615 237 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RPE1P46969 238 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ATG36P46983 293 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ALY2P47029 1046 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data2.99□□□□□ -1.93not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B NMA111P53920 997 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MIX14Q04341 121 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG8P24521 451 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B STB6P36085 766 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B EFM2P38347 419 aa2.98□□□□□ -1.93
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