RNA–Protein interactions for RNA: YOR036W

PEP12, Transcript of Target membrane receptor (t-SNARE), yeast

Gene PEP12, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEP12	YOR036W	APL4	Q12028	832 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YLR049C	Q12110	428 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	RLM1	Q12224	676 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SGS1	P35187	1447 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	CLB3	P24870	427 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ADK2	P26364	225 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	GAC1	P28006	793 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	PXA2	P34230	853 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	CMC1	P36064	111 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	VPS41	P38959	992 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	AFG3	P39925	761 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	DOT5	P40553	215 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YTP1	P53584	459 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ASI1	P54074	624 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	MSC1	Q03104	513 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	RMT2	Q03305	412 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	GRC3	Q07845	632 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	TEN1	Q07921	160 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SEC39	Q12745	709 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	PUT2	P07275	575 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	PMS1	P14242	873 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YCR006C	P25350	157 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SNT1	P25357	1226 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	BOS1	P25385	244 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	PPZ1	P26570	692 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	BUD14	P27637	709 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	DBF4	P32325	704 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SAS3	P34218	831 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YKL100C	P34248	587 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	BLI1	P35727	113 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	DBP8	P38719	431 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	CIN4	P39110	191 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	VRG4	P40107	337 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YJL068C	P40363	299 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YPT11	P48559	417 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	IPI3	P53877	555 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	SWF1	Q04629	336 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ISN1	Q99312	450 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEP12	YOR036W	ARG81	P05085	880 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	CLC1	P17891	233 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	CNA1	P23287	553 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	ELO2	P25358	347 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	PMT1	P33775	817 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	ICS2	P38284	255 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	UBA4	P38820	440 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	YND1	P40009	630 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	HXT14	P42833	540 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	SAD1	P43589	448 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	PTR3	P43606	678 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	SGF73	P53165	657 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	YNL144C	P53907	740 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	CAC2	Q04199	468 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	TAP42	Q04372	366 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	ATG26	Q06321	1198 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	SMC6	Q12749	1114 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	CBP1	P07252	654 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	YCR051W	P25631	222 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	STB6	P36085	766 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	MSR1	P38714	643 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	ANS1	P38832	159 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	SSU1	P41930	458 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	AIM22	P47051	409 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	UBP8	P50102	471 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	VPS9	P54787	451 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	BET4	Q00618	327 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	RSM23	Q01163	450 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	RCF1	Q03713	159 aa		2.64	□□□□□ -1.99
PEP12	YOR036W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99

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