RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W ATP4P05626 244 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W CTT1P06115 562 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W CNA1P23287 553 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MRPL25P23369 157 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SPS22P25380 463 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W KRE2P27809 442 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W GYP6P32806 458 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W BMH2P34730 273 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W JNM1P36224 373 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YHB1P39676 399 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YFH7P43591 353 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W ASE1P50275 885 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MET14Q02196 202 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W TRS31Q03337 283 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W MCP2Q06567 569 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W IRC3Q06683 689 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W BUG1Q12191 341 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W SCM3Q12334 223 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W NCA2Q12374 616 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.9□□□□□ -1.78
HCA4YJL033W GCN3P14741 305 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W CLB2P24869 491 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W HCS1P34243 683 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W CTM1P38818 585 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W IMA5P40884 581 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YNL320WP42840 284 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YFL015CP43578 164 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W TAX4P47030 604 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W URB2P47108 1174 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W PIP2P52960 996 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W MMT1Q03218 510 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W DML1Q03652 475 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W ARP9Q05123 467 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YDR278CQ05612 105 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W MLC2Q06580 163 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W AAD4Q07747 329 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YAP7Q08182 245 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W UIP4Q08926 304 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W RUP1Q12242 671 aa3.9□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W PET494P07390 489 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W SRV2P17555 526 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GDA1P32621 518 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YKR015CP36111 568 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W NPT1P39683 429 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W FCY21P40039 528 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W SMX2P40204 77 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W ALG5P40350 334 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W POL31P46957 487 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W MRM2P53123 320 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W COS6P53344 381 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W ACS1Q01574 713 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W THI7Q05998 598 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.89□□□□□ -1.79not detected
HCA4YJL033W YOL114CQ12322 202 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W FLO11P08640 1367 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W NUC1P08466 329 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W ERG11P10614 530 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W SNF3P10870 884 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W SEC63P14906 663 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W AST1P35183 429 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W RCN1P36054 211 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W STT3P39007 718 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W EXO1P39875 702 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W DON1Q05610 365 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YPR172WQ06608 200 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GET4Q12125 312 aa3.89□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GAL1P04385 528 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W PTP2P29461 750 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GPI10P30777 616 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W HOT13P36078 116 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W JEM1P40358 645 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GCD10P41814 478 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W LAM5P43560 674 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W TOS3P43637 560 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W TEP1P53916 434 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W GTB1Q04924 702 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W TUS1Q06412 1307 aa3.88□□□□□ -1.79
HCA4YJL033W YML002WP0CF17 737 aa3.88□□□□□ -1.79
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