RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CMA1	P23946	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015		Q9H521	79 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MYL1	P05976	194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ADCY8	P40145	1251 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TNKS	O95271	1327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	MGEA5	O60502	916 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	STMN1	P16949	149 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	SURF1	Q15526	300 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ITK	Q08881	620 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	KRIT1	O00522	736 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	BFSP1	Q12934	665 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	MTX1	Q13505	466 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	PSMD6	Q15008	389 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	BBOX1	O75936	387 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TEC	P42680	631 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	NEO1	Q92859	1461 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ATF2	P15336	505 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	GSTA1	P08263	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	GSTA2	P09210	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	PFKFB1	P16118	471 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	LRMP	Q12912	555 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	MED7	O43513	233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	CHRND	Q07001	517 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ADAM9	Q13443	819 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ALCAM	Q13740	583 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	IFNB1	P01574	187 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	CCND2	P30279	289 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-223	ENST00000637015	SEPT2	Q15019	361 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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