RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 GORASP1Q9BQQ3 440 aa19.51■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 M0R2C6 588 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 SMIM24O75264 130 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CXCR5P32302 372 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 ABL2P42684 1182 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 RIPK1Q13546 671 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 ATL2Q8NHH9 583 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CCHCR1Q8TD31 782 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PICK1Q9NRD5 415 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 ESYT3A0FGR9 886 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 KCNJ18B7U540 433 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 KCNJ12Q14500 433 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NOSTRINQ8IVI9 506 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CNKSR1Q969H4 720 aa19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2Q2LH0YL09 131 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 DIAPH2O60879 1101 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 UPP2O95045 317 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 TCP11X2Q5H9J9 407 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 IFT20Q8IY31 132 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CSRNP2Q9H175 543 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 SENP2Q9HC62 589 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CLTAP09496 248 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 TMOD1P28289 359 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CYP27A1Q02318 531 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 SPAG1Q07617 926 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NFRKBQ6P4R8 1299 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC170Q8IYT3 715 aa19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GLI1P08151 1106 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GHRP10912 638 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 P3H4Q92791 437 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 LGR6Q9HBX8 967 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 COPRSQ9NQ92 184 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087X0B3 334 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PPIP5K2O43314 1243 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 KIF5AQ12840 1032 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NCOA7Q8NI08 942 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 AGAP11Q8TF27 550 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PAGE5Q96GU1 130 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PLAAQ9Y263 795 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa19.48■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 C5orf60A6NFR6 353 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GOLGA6L10A6NI86 522 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 BTBD18B2RXH4 712 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MYBL1P10243 752 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PAK2Q13177 524 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MREGQ8N565 214 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 EPB41L5Q9HCM4 733 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM94Q12767 1356 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MAFGO15525 162 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 TMBIM4Q9HC24 238 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC63Q8NA47 563 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GSDMAQ96QA5 445 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GUCY2DQ02846 1103 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 GDF3Q9NR23 364 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CAPN11Q9UMQ6 739 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 USP6P35125 1406 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 TACC1O75410 805 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MYL1P05976 194 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 IARSP41252 1262 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 PAFAH1B1P43034 410 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 MICU3Q86XE3 530 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 NDST4Q9H3R1 872 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 CPDO75976 1380 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS1-202ENST00000628545 DPPA5A6NC42 116 aa19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms