RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	LPAR1	Q92633	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	UFL1	O94874	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CLUL1	Q15846	466 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RUBCN	Q92622	972 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ESPN	B1AK53	854 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	F11	P03951	625 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	INPP5B	P32019	993 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	LTBR	P36941	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PPAT	Q06203	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	LRP8	Q14114	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	STXBP3	O00186	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	MBTPS2	O43462	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	EPX	P11678	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RHOQ	P17081	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TGM1	P22735	817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PDE4D	Q08499	809 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	USP6NL	Q92738	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PI15	O43692	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DYRK3	O43781	588 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	FGB	P02675	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	THBS1	P07996	1170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SPINK2	P20155	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SDHB	P21912	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CNGA1	P29973	690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	HAUS7	Q99871	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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