RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 NT5C2P49902 561 aa24.75■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 IQCA1Q86XH1 822 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 KIFC2Q96AC6 838 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 PGBD1Q96JS3 809 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 FEM1BQ9UK73 627 aa24.75■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 B4E1Z4 1266 aa24.74■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.74■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.74■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 NID2Q14112 1375 aa24.73■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 RNF214Q8ND24 703 aa24.73■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.73■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 ERCC3P19447 782 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 NOVP48745 357 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 C8orf76Q96K31 380 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 LY9Q9HBG7 655 aa24.72■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 MYH4Q9Y623 1939 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 POTEFA5A3E0 1075 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 PTPREP23469 700 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 STAT3P40763 770 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 RGS2P41220 211 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 STAT2P52630 851 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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SGMS1-210ENST00000619438 BRAPQ7Z569 592 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 MROH8Q9H579 483 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 DACT1Q9NYF0 836 aa24.71■■□□□ 1.55
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A27O95847 323 aa24.7■■□□□ 1.54
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SGMS1-210ENST00000619438 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 STRNO43815 780 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 MTFR1Q15390 333 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 MORN1Q5T089 497 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 FAM160B2Q86V87 743 aa24.69■■□□□ 1.54
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SGMS1-210ENST00000619438 CPXCR1Q8N123 301 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 PLXNB2O15031 1838 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB43O43298 467 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 INHAP05111 366 aa24.69■■□□□ 1.54
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SGMS1-210ENST00000619438 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 DPP9Q86TI2 863 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 USP28Q96RU2 1077 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 RNF208Q9H0X6 261 aa24.69■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.69■■□□□ 1.54
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SGMS1-210ENST00000619438 DCAF4Q8WV16 495 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 PARP14Q460N5 1801 aa24.68■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 CCL5P13501 91 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TMTC2Q8N394 836 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 TNMDQ9H2S6 317 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 KAT14Q9H8E8 782 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 STK36Q9NRP7 1315 aa24.67■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 HMGCRP04035 888 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 FDX1P10109 184 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 FCER1AP12319 257 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 GUCY1B3Q02153 619 aa24.66■■□□□ 1.54
SGMS1-210ENST00000619438 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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