RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PBX1P40424 430 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TECP42680 631 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CALML4Q96GE6 196 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GDAQ9Y2T3 454 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CALCRLQ16602 461 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLIN2Q99541 437 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAB34Q9BZG1 259 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZBTB5O15062 677 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CUL5Q93034 780 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTMR9Q96QG7 549 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLRC4O43908 158 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TPM1P09493 284 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RXRBP28702 533 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT31Q15323 416 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POTEDQ86YR6 584 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MKL1Q969V6 931 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTMR8Q96EF0 704 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NYAP2Q9P242 653 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH8P13535 1937 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMA7O14818 248 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 N4BP3O15049 544 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R2P41236 205 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TXKP42681 527 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCP10Q12799 353 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD7Q92527 254 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNJ18B7U540 433 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNJ12Q14500 433 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCAF4Q8WV16 495 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC18Q9H819 358 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDIA5Q14554 519 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCTD1Q719H9 257 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNGA4Q8IV77 575 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC51Q96ER9 411 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM9Q9C026 710 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CACNB3P54284 484 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBL2Q08999 1139 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EXOC1Q9NV70 894 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L10C9JJH3 530 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COBLO75128 1261 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC16A2P36021 539 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNNI2P48788 182 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM14Q14142 442 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 THAP9Q9H5L6 903 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STK17AQ9UEE5 414 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHRNA5P30532 468 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC1A4P43007 532 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC15Q8TF66 581 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MFAP3LO75121 409 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms