RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 RNF146Q9NTX7 359 aa23.14■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 PLXNB2O15031 1838 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 CTDNEP1O95476 244 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 CTGFP29279 349 aa23.13■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 WDR78Q5VTH9 848 aa23.13■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 TRIM47Q96LD4 638 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 ACAD9Q9H845 621 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 FCER1AP12319 257 aa23.12■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 HOXD10P28358 340 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 ST3GAL1Q11201 340 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 PKN1Q16512 942 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 RGS22Q8NE09 1264 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 STK36Q9NRP7 1315 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.11■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 DEXIO95424 95 aa23.11■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.11■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 CAP1Q01518 475 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 KCTD2Q14681 263 aa23.1■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 MMP19Q99542 508 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 GJD2Q9UKL4 321 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-232ENST00000600209 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.09■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.08■■□□□ 1.29
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FCHO1-232ENST00000600209 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.07■■□□□ 1.28
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FCHO1-232ENST00000600209 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-232ENST00000600209 USP6NLQ92738 828 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-232ENST00000600209 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
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FCHO1-232ENST00000600209 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-232ENST00000600209 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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