RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
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PDE4C-211ENST00000597360 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa17.1■□□□□ 0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MST1RQ04912 1400 aa17.1■□□□□ 0.33
PDE4C-211ENST00000597360 DIAPH2O60879 1101 aa17.1■□□□□ 0.33
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PDE4C-211ENST00000597360 GLI1P08151 1106 aa17.09■□□□□ 0.33
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PDE4C-211ENST00000597360 SNX1Q13596 522 aa17.09■□□□□ 0.33
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PDE4C-211ENST00000597360 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
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PDE4C-211ENST00000597360 SCARF1Q14162 830 aa17.08■□□□□ 0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MFSD6Q6ZSS7 791 aa17.08■□□□□ 0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.08■□□□□ 0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
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PDE4C-211ENST00000597360 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 RASSF9O75901 435 aa17.07■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.07■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 ZSWIM5Q9P217 1185 aa17.07■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.07■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 ANO9A1A5B4 782 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 ANP32DO95626 131 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 NLRP5P59047 1200 aa17.06■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.06■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 DCCP43146 1447 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 USP31Q70CQ4 1352 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 ITIH6Q6UXX5 1313 aa17.06■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa17.06■□□□□ 0.32
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PDE4C-211ENST00000597360 KSR1Q8IVT5 923 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 NOX5Q96PH1 765 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 CEP104O60308 925 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM87BQ96K49 555 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 STRN4Q9NRL3 753 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 SAMD15Q9P1V8 674 aa17.05■□□□□ 0.32
PDE4C-211ENST00000597360 H7C1D1 291 aa17.05■□□□□ 0.32
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