RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 ZBBXA8MT70 800 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 RAB11FIP3O75154 756 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ARHGEF15O94989 841 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 TLK2Q86UE8 772 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 HLA-CQ95604 372 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CERS4Q9HA82 394 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 FBXO40Q9UH90 709 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 HMMRO75330 724 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PFKMP08237 780 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PTGS1P23219 599 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CNTN2Q02246 1040 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 SBK1Q52WX2 424 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CHST13Q8NET6 341 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 KIFC2Q96AC6 838 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CD320Q9NPF0 282 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 MYH4Q9Y623 1939 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ZBED4O75132 1171 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 OAZ1P54368 228 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 TAP1Q03518 808 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 LPXNO60711 386 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 SMPD1P17405 629 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PSMC6P62333 389 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 USP34Q70CQ2 3546 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ZEB2O60315 1214 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CEP95Q96GE4 821 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 SLC9A7Q96T83 725 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 FEM1BQ9UK73 627 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 Q9Y3F1 56 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 SCN5AQ14524 2016 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 TRIOO75962 3097 aa15.78■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PRR33A8MZF0 331 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 PRDM1O75626 825 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 CYP2C9P11712 490 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 GRB10Q13322 594 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 MKL1Q969V6 931 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 COG6Q9Y2V7 657 aa15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CTIF-211ENST00000592658 ASB14A6NK59 587 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 SPRED2Q7Z698 418 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 OSBP2Q969R2 916 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 ACAD9Q9H845 621 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.76■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 ZNF536O15090 1300 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 TNKSO95271 1327 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 BMP3P12645 472 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 ACTN1P12814 892 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 RFC2P35250 354 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 SLFN13Q68D06 897 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 APPBP2Q92624 585 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.75■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 GPAA1O43292 621 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 TTLL1O95922 423 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 FDX1P10109 184 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 MS4A1P11836 297 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CTIF-211ENST00000592658 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms