RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPLAH	O14841	1288 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNA11	P29992	359 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT2	P35908	639 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	REST	Q13127	1097 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLS1	Q14651	629 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIPK3	Q9Y572	518 aa		10.52	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALAS1	P13196	640 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	10.51	□□□□□ -0.73	7e-7	■■■■□ 23.1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADCY7	P51828	1080 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	OAZ1	P54368	228 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF1	Q13077	416 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MB21D1	Q8N884	522 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP2A1	O14983	1001 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAT3	P40763	770 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GALNT17	Q6IS24	598 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CUL5	Q93034	780 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	INHBE	P58166	350 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0R2N6	131 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFIB	O00712	420 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	AOC2	O75106	756 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOG	Q13253	232 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2S	Q16763	222 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNL1	Q8IU54	200 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCB11	O95342	1321 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SREBF2	Q12772	1141 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		10.5	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MEIS2	O14770	477 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNMD	O75829	334 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFB	P00751	764 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q3C1V9	767 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRAP	Q7Z569	592 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JMZ2	1700 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TM4SF4	P48230	202 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		10.49	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERVK-24	P63145	666 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.48	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms