RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMA5P28066 241 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 LIFRP42702 1097 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTN2Q02246 1040 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 GRM4Q14833 912 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 TKFCQ3LXA3 575 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEGQ6S5H5 508 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 NSMFQ6X4W1 530 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZUG5 572 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO11Q86XK2 927 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 MAML3Q96JK9 1138 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 MTA3Q9BTC8 594 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 ACAD9Q9H845 621 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 RPTORQ8N122 1335 aa7.92□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEB2H3BUK9 544 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 SGPL1O95470 568 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS6KB1P23443 525 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 APOBRQ0VD83 1088 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 HOMER1Q86YM7 354 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 FANCBQ8NB91 859 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D5Q92609 795 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB118Q96PH6 123 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 PIGSQ96S52 555 aa7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 MCM3APO60318 1980 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 NFIBO00712 420 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CYTH3O43739 400 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 DDAH1O94760 285 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 GJB1P08034 283 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CALM1P0DP23 149 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CALM2P0DP24 149 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CALM3P0DP25 149 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CALML3P27482 149 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF5BP33176 963 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 ANO1Q5XXA6 986 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 RUFY3Q7L099 469 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPV1Q8NER1 839 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 BRF1Q92994 677 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K14Q99558 947 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 TINF2Q9BSI4 451 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.9□□□□□ -1.14
EFTUD2-211ENST00000588374 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PFASO15067 1338 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCB11O95342 1321 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB5O15062 677 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB43O43298 467 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 GJA8P48165 433 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS19P49795 217 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 GNAQP50148 359 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 APOA5Q6Q788 366 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MICU3Q86XE3 530 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MTMR8Q96EF0 704 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 AMNQ9BXJ7 453 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121 ms