RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM232C9JQI7 657 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 TNFAIP2Q03169 654 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC174Q6PII3 467 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 TLK2Q86UE8 772 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 SMPD1P17405 629 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 COL9A1P20849 921 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 SNAP25P60880 206 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 HIPK3Q9H422 1215 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-204ENST00000587324 PTPRSQ13332 1948 aa22.33■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 CCL23P55773 120 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 PSMC6P62333 389 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ITGA7Q13683 1181 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 RAB30Q15771 203 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ASB2Q96Q27 587 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 B4GALT4O60513 344 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 STAT2P52630 851 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 RABGGTBP53611 331 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 MSRAQ9UJ68 235 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 FOXP2O15409 715 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 FGBP02675 491 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 MYOGP15173 224 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 IGFBP4P22692 258 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 GMCL1Q96IK5 515 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 APPP05067 770 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TSPY3P0CV98 308 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TSPY8P0CW00 308 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ALAS1P13196 640 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 GNAT2P19087 354 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 MCCP23508 829 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TFAP4Q01664 338 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 KCTD1Q719H9 257 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 SCLYQ96I15 445 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ASB14A6NK59 587 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 CABYRO75952 493 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 FDX1P10109 184 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 FAM160B2Q86V87 743 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 INCENPQ9NQS7 918 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 NMT2O60551 498 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 SLC1A4P43007 532 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 PPARAQ07869 468 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 TKFCQ3LXA3 575 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-204ENST00000587324 PLA2G6O60733 806 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 MORC4Q8TE76 937 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 DCTPP1Q9H773 170 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 PDE4BQ07343 736 aa22.25■■□□□ 1.15
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UBXN6-204ENST00000587324 TTLL4Q14679 1199 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 CYP2C9P11712 490 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 NAPBQ9H115 298 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-204ENST00000587324 TFF2Q03403 129 aa22.23■■□□□ 1.15
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