RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 DTNBO60941 627 aa36.35■■■■□ 3.41
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GIPC1-205ENST00000586027 GRB14Q14449 540 aa36.35■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGEF6Q15052 776 aa36.35■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 GTF3C6Q969F1 213 aa36.35■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 ACAD9Q9H845 621 aa36.35■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa36.35■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 MYH6P13533 1939 aa36.34■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 NFIBO00712 420 aa36.34■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
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GIPC1-205ENST00000586027 MMP19Q99542 508 aa36.34■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 PNMA2Q9UL42 364 aa36.34■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 SLC15A5A6NIM6 579 aa36.33■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 FLT3LGP49771 235 aa36.33■■■■□ 3.41
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GIPC1-205ENST00000586027 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa36.33■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 ABCB11O95342 1321 aa36.32■■■■□ 3.41
GIPC1-205ENST00000586027 STRNO43815 780 aa36.32■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 HOXD10P28358 340 aa36.31■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 ABRAQ8N0Z2 381 aa36.31■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 IL27Q8NEV9 243 aa36.31■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 SLC26A6Q9BXS9 759 aa36.3■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 KCTD2Q14681 263 aa36.29■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 PKN1Q16512 942 aa36.29■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP36.29■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 ANKRD35Q8N283 1001 aa36.28■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 TBC1D5Q92609 795 aa36.28■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa36.28■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 CYP2B6P20813 491 aa36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 WWC2Q6AWC2 1192 aa36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 NSMFQ6X4W1 530 aa36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 PRMT2P55345 433 aa36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa36.27■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 NPLOC4Q8TAT6 608 aa36.27■■■■□ 3.4
GIPC1-205ENST00000586027 CYP39A1Q9NYL5 469 aa36.27■■■■□ 3.4
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GIPC1-205ENST00000586027 SLC30A10Q6XR72 485 aa36.25■■■■□ 3.39
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GIPC1-205ENST00000586027 HOXC6P09630 235 aa36.24■■■■□ 3.39
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GIPC1-205ENST00000586027 TMX3Q96JJ7 454 aa36.24■■■■□ 3.39
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GIPC1-205ENST00000586027 MCM2P49736 904 aa36.23■■■■□ 3.39
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GIPC1-205ENST00000586027 CCL14Q16627 93 aa36.23■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF792Q3KQV3 632 aa36.23■■■■□ 3.39
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GIPC1-205ENST00000586027 RGS22Q8NE09 1264 aa36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 SHISA4Q96DD7 197 aa36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 BARHL2Q9NY43 387 aa36.21■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 FLRT1Q9NZU1 646 aa36.21■■■■□ 3.39
GIPC1-205ENST00000586027 ELNP15502 786 aa36.2■■■■□ 3.39
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