RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 TROAPQ12815 778 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TMTC2Q8N394 836 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 LIFRP42702 1097 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ANO1Q5XXA6 986 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 LHX8Q68G74 356 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 FBXO11Q86XK2 927 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 HOMER1Q86YM7 354 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 FGD4Q96M96 766 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ABCB11O95342 1321 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SEPT4O43236 478 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RXRAP19793 462 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CALML3P27482 149 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 KIF5BP33176 963 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 FGD1P98174 961 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ZBTB5O15062 677 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CALM1P0DP23 149 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CALM2P0DP24 149 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CALM3P0DP25 149 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ARMCX2Q7L311 632 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 KCNB2Q92953 911 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PIGSQ96S52 555 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MAP3K14Q99558 947 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 AMNQ9BXJ7 453 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MYH6P13533 1939 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ASB14A6NK59 587 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CPA1P15085 419 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 GNAQP50148 359 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ACVR2BQ13705 512 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MICU3Q86XE3 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MTMR8Q96EF0 704 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 USP26Q9BXU7 913 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CYTH3O43739 400 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 RARBP10826 455 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 AKR1A1P14550 325 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PSMA5P28066 241 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ASTN1O14525 1302 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms