RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SIL1	Q9H173	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH1	P12882	1939 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	EYA2	O00167	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PRMT3	O60678	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC5A1	P13866	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	WEE1	P30291	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	BTD	P43251	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIB2	Q92519	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	LPIN2	Q92539	896 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ENTPD3	O75355	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	BRD1	O95696	1058 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HMGCR	P04035	888 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	BMP8B	P34820	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	NOS2	P35228	1153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	HMGCS2	P54868	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	RHBDL3	P58872	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	JAG1	P78504	1218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	POU4F2	Q12837	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TEAD4	Q15561	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH8	P13535	1937 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTPRM-206	ENST00000578093	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	LGR5	O75473	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	COL6A1	P12109	1028 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2B6	P20813	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PHKA2	P46019	1235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MECOM	Q03112	1051 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SPP2	Q13103	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	CCL14	Q16627	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	COA7	Q96BR5	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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