RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF536	O15090	1300 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ASB14	A6NK59	587 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	GPAA1	O43292	621 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	GNAT2	P19087	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	IGFBP4	P22692	258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SMPD1	P17405	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PTGS1	P23219	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TDO2	P48775	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	STAT2	P52630	851 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169		Q9Y3F1	56 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169		M0R2C6	588 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ZEB2	O60315	1214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	B4GALT4	O60513	344 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PLA2G6	O60733	806 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	RABGGTB	P53611	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	CCL23	P55773	120 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	APP	P05067	770 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	ALAS1	P13196	640 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	BMP1	P13497	986 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	SLC1A4	P43007	532 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PSMC6	P62333	389 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TFAP4	Q01664	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PDE4B	Q07343	736 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TCF4-238	ENST00000568169	MYOG	P15173	224 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MCC	P23508	829 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PFKM	P08237	780 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PPARA	Q07869	468 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	POTEH	Q6S545	545 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	SCLY	Q96I15	445 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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